Чаще всего дело в нейросети, которой нет в каталоге сайта на момент импорта (модуль был удалён или переименован), или в устаревшем формате файла. При импорте система проверяет, что все модули существуют, и помечает проблемные шаги красным — рядом с ними будет подсказка, что именно не нашлось. Замените такие модули на существующие (через каталог «Добавить модуль») и переподключите связи. Если файл вообще не открывается, убедитесь, что у него корректное поле kind = "bratuha.pipeline" и version = 1.